ОГБУЗ «Белгородское бюро судебно-медицинской экспертизы» образовано в августе 1954 года приказом отдела здравоохранения Белгородского облисполкома.
Областное бюро и отделения в районах области располагались в тесных неприспособленных помещениях. В 1954 году в бюро начало работать судебно-гистологическое отделение, в 1955 году – судебно-биологическое, в 1961 году – судебно-химическое, а в 1965 году физико-техническое (сейчас медико-криминалистическое) отделения. Морг находился в подвальном помещении первой городской больницы.
В 1973 году, благодаря настойчивости начальника бюро Мастерова В.Ф., бюро было предоставлено новое здание патологоанатомического отделения городской инфекционной больницы им. Е.Н. Павловского на улице Садовая, дом 122, общей площадью 496 кв.м. с отдельной территорией.
В связи с увеличивающимся объемом работ в 1994 году перевели отдел сложных экспертиз, судебно-биологическое отделение и отделение судебно-медицинской экспертизы потерпевших, обвиняемых и других лиц по 1-ому пер. ул. Мичурина, 18.
Финансирование по остаточному принципу не позволяло своевременно и эффективно обновлять оборудование бюро, расширять сеть его отделений, решать кадровые вопросы. Возросший объем и сложность экспертных работ, повышение требований к их уровню и доказательности, работа с постоянными перегрузками не могли не сказаться на сроках и качеству выполняемых экспертных работ. Решить проблемы, копившиеся годами, руководство бюро и здравоохранения области не могло.
Прокурор Белгородской области Кондрашев П.П. обратился к главе администрации области Савченко Е.С., который после личного посещения бюро 28.08.2002 года, дал поручение внести предложения по созданию базы судебно-медицинской службы области. В конце этого же года было подписано постановление «О неотложных мерах по совершенствованию деятельности судебно-экспертных медицинских учреждений области на 2002-2006 годы». Впервые в истории области были не только определены конкретные меры по укреплению материально технической базы службы с выделением помещений всем подразделениям бюро, приобретением современного оборудования и оргтехники, ее кадрового потенциала, но и размеры и источники финансирования, контроль за выполнением намеченного.
Во исполнение постановления было приобретено, реконструировано и оснащено современным оборудованием здание по ул. Волчанской, 159, три этажа которого общей площадью более 2,4 тыс.кв.м. переданы в оперативное управление бюро. Построено здание для Новооскольского районного отделения, реконструированы здания в г.г. Валуйки, Старый Оскол и Шебекино, Короча, предоставлены дополнительные площади в г.г. Алексеевка и Губкин, п.п. Борисовка, Волоконовка, Ракитное. Построено и сдано в эксплуатацию в 2009 году здание для Белгородского межрайонного отделения судебно-медицинской экспертизы трупов, а в 2013 году гараж для автотранспорта бюро.
В настоящее время бюро располагает достаточной материально-технической базой, на должном уровне и в установленные сроки в год выполняет более 40 тысяч различных видов судебно-медицинских работ.